Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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