Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPAQ06546 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms