Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms