Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms