Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC10Q01780 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms