Protein–RNA interactions for Protein: Q01546

KRT76, Keratin, type II cytoskeletal 2 oral, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT76Q01546 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRT76Q01546 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT76Q01546 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms