Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms