Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms