Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms