Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms