Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P63121 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms