Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms