Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms