Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCR4P51679 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCR4P51679 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCR4P51679 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCR4P51679 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCR4P51679 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCR4P51679 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCR4P51679 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCR4P51679 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCR4P51679 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCR4P51679 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCR4P51679 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCR4P51679 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCR4P51679 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCR4P51679 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCR4P51679 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCR4P51679 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCR4P51679 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCR4P51679 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms