Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRCA2P51587 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms