Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLK1P49759 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLK1P49759 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLK1P49759 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLK1P49759 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLK1P49759 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLK1P49759 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLK1P49759 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLK1P49759 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLK1P49759 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLK1P49759 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLK1P49759 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLK1P49759 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms