Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP4P49662 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP4P49662 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP4P49662 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP4P49662 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP4P49662 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms