Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIA4P48058 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms