Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RANGAP1P46060 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms