Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NTF4P34130 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTF4P34130 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTF4P34130 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTF4P34130 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTF4P34130 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTF4P34130 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTF4P34130 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTF4P34130 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTF4P34130 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTF4P34130 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTF4P34130 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NTF4P34130 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTF4P34130 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTF4P34130 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTF4P34130 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTF4P34130 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTF4P34130 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NTF4P34130 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NTF4P34130 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NTF4P34130 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms