Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms