Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNMT1P26358 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT1P26358 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms