Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms