Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA6P23229 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms