Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XPAP23025 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XPAP23025 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XPAP23025 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XPAP23025 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XPAP23025 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XPAP23025 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XPAP23025 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XPAP23025 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XPAP23025 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XPAP23025 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XPAP23025 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XPAP23025 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XPAP23025 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XPAP23025 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XPAP23025 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XPAP23025 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XPAP23025 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms