Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2CP19387 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms