Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CREB1P16220 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CREB1P16220 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CREB1P16220 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CREB1P16220 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CREB1P16220 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CREB1P16220 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CREB1P16220 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms