Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSPP15924 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSPP15924 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSPP15924 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSPP15924 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSPP15924 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSPP15924 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSPP15924 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSPP15924 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSPP15924 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
DSPP15924 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSPP15924 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DSPP15924 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DSPP15924 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DSPP15924 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms