Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRA1P14867 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA1P14867 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms