Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN1P12814 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms