Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL6A2P12110 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms