Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODC1P11926 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODC1P11926 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms