Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC166P0CW27 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms