Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPRCP08575 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPRCP08575 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPRCP08575 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPRCP08575 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPRCP08575 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPRCP08575 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PTPRCP08575 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRCP08575 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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PTPRCP08575 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
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