Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
APODP05090 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APODP05090 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APODP05090 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APODP05090 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APODP05090 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APODP05090 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APODP05090 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APODP05090 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APODP05090 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APODP05090 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APODP05090 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APODP05090 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APODP05090 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
APODP05090 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APODP05090 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
APODP05090 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
APODP05090 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APODP05090 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APODP05090 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APODP05090 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APODP05090 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APODP05090 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms