Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFP01375 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFP01375 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFP01375 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFP01375 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFP01375 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFP01375 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFP01375 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFP01375 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFP01375 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFP01375 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFP01375 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFP01375 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFP01375 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFP01375 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFP01375 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFP01375 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFP01375 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFP01375 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFP01375 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFP01375 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFP01375 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFP01375 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFP01375 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFP01375 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFP01375 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms