Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POP4O95707 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
POP4O95707 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POP4O95707 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POP4O95707 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POP4O95707 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POP4O95707 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POP4O95707 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POP4O95707 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POP4O95707 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms