Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24BO95487 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC24BO95487 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms