Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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SEC22BO75396 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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SEC22BO75396 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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SEC22BO75396 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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SEC22BO75396 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SEC22BO75396 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SEC22BO75396 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SEC22BO75396 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SEC22BO75396 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SEC22BO75396 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SEC22BO75396 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22BO75396 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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