Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP2O75323 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms