Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC8O43402 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC8O43402 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms