Protein–RNA interactions for Protein: O00743

PPP6C, Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6CO00743 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP6CO00743 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP6CO00743 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP6CO00743 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP6CO00743 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP6CO00743 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP6CO00743 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP6CO00743 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP6CO00743 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP6CO00743 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP6CO00743 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP6CO00743 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPP6CO00743 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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