Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms