Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms