Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PCH4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PCH4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PCH4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PCH4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PCH4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PCH4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PCH4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PCH4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PCH4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PCH4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PCH4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PCH4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PCH4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PCH4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PCH4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PCH4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PCH4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PCH4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PCH4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PCH4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PCH4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PCH4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PCH4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PCH4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PCH4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PCH4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PCH4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PCH4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
E9PCH4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
E9PCH4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
E9PCH4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PCH4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PCH4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms