Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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