Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4DGG1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DGG1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DGG1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DGG1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DGG1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DGG1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DGG1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DGG1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DGG1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DGG1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DGG1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DGG1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DGG1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DGG1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4DGG1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4DGG1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms