Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HELTA6NFD8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms