Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms