Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NINLQ9Y2I6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINLQ9Y2I6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NINLQ9Y2I6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINLQ9Y2I6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINLQ9Y2I6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINLQ9Y2I6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINLQ9Y2I6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINLQ9Y2I6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NINLQ9Y2I6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINLQ9Y2I6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms